中国生态系统研究网络CERN专题 I 区论文(评审中) 版本 ZH2
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湖北神农架动物模式标本名录
The catalogue of animal type specimens in Shennongjia, Hubei Province, China
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: 2019 - 08 - 29
: 2020 - 01 - 17
: 2020 - 01 - 17
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摘要&关键词
摘要:模式物种是新种发表的依据,在分类学及相关科学研究中具有重要意义。本数据集在《神农架动物模式标本名录》和《中国昆虫模式标本名录》(第1、2、3卷)的基础上,对湖北省神农架地区的动物模式标本进行了信息汇总、核实、厘定和整理。包含了以采自神农架地区的标本为模式标本确立的动物物种915种,隶属于3门8纲31目187科,以及14种厘定为无效模式标本的物种。本数据集中的每条记录都涵盖了相应物种的有效性、分类信息、模式标本(正模配模和副模)的数量、采集地点、采集时间、原始文献中的标本存放地、是否凭证标本仅来自于神农架地区、参考文献及备注,对相关分类学及科学研究具有重要的参考价值,可为湖北省动物保护工作提供科学依据。
关键词:神农架;模式标本;动物
Abstract & Keywords
Abstract: Type specimens are the basis of the publication of new species and are of great significance in taxonomy and related scientific research. This dataset summarizes, verifies, and determines the animals’ type specimens in Shennongjia, Hubei Province, China, based on the book Catalogue of the Animal Type Specimens Deposited in Shennongjia and the series of books Catalogue of the Insect Type Specimens Deposited in China (Volumes 1, 2, 3). The dataset covered 915 animal species including type specimens collected from Shennongjia area (3 phylums, 8 classes, 31 orders and 187 families). Meanwhile, 14 species that used to be identified as ineffective specimens were specifically compiled. In this dataset, each record covered availability and classification information of corresponding species, number of type specimens (i.e., holotype, allotype and paratype), collection location, collection time, specimen storage location in the original literature, whether the specimens were merely from Shennongjia, reference materials and remarks. This dataset effectively supported the related taxonomy and scientific research, and hopefully it can provide a scientific basis for animal protection work, Hubei Province, in the near future.
Keywords: Shennongjia; type specimens; animals
数据库(集)基本信息简介
数据库(集)名称湖北神农架动物模式标本名录
数据作者吴楠,雷博宇,周友兵,谢宗强
数据通信作者谢宗强(xie@ibcas.ac.cn)
数据时间范围文献发表时间:1950–2016年;物种采集时间:1957–2014年
地理区域湖北神农架(东经109°29′34.8″–111°56′24″、北纬30°57′28.8″–32°14′6″)
数据格式*.xlsx
数据量249 KB
数据服务系统网址http://www.sciencedb.cn/dataSet/handle/861
基金项目CERN监测网络,国家生态系统观测研究共享服务平台(2005DKA10300)。
数据库(集)组成整个数据集共由929条记录组成,分别包括(1)以采自神农架的标本为模式标本确定的动物物种915种,隶属于3门8纲31目187科;(2)14种甄别为无效模式标本的物种。数据内容由31个部分组成,分别为:编号、物种有效性、门、门拉丁名、纲、纲拉丁名、目、目拉丁名、科、科拉丁名、属拉丁名、中文名、拉丁学名、正模数量、正模性别、正模采集地点、正模采集时间、正模原始文献中的标本存放地、配模数量、配模性别、配模采集地点、配模采集时间、配模原始文献中的标本存放地、副模数量、副模性别、副模采集地点、副模采集时间、副模原始文献中的标本存放地、凭证标本是否仅来自于神农架地区、参考文献及备注。
Dataset Profile
TitleThe catalogue of animal type specimens in Shennongjia, Hubei Province, China
Data authorsNan Wu, Boyu Lei, Youbing Zhou, Zongqiang Xie
Data corresponding authorsXie Zongqiang(xie@ibcas.ac.cn)
Time rangePublication time: From 1950 to 2016;
Collection time: From 1957 to 2014
Geographical scopeShennongjia, Hubei Province, China (109°29′34.8″–111°56′24″E, 30°57′28.8″–32°14′6″N).
Data format*.xlsx
Data volume249 KB
Data service system<http://www.sciencedb.cn/dataSet/handle/861>
Sources of fundingCERN,National Ecosystem Observation and Research Sharing Service Platform Project (2005DKA10300).
Dataset compositionThis data consisted of 929 records, including: (1) 915 animal species which type specimens collected from Shennongjia area, belonging to 3 phylums, 8 classes, 31 orders and 187 families; (2) 14 species that used to be identified as ineffective specimens were specifically compiled. The data also consisted of 31 parts, respectively was: species number, species availability, phylum, phylum Latin name, class, class Latin name, order, order Latin name, family, family Latin name, genus Latin name, species Chinese name, species Latin name; type specimens number, gender, collection location, collection time, the specimen storage location in the original literature (i.e., holotype, allotype and paratype, respectively); whether the specimens are only from Shennongjia area, reference materials and remarks.
引 言
神农架位于中国地势第二阶梯的东部边缘,地处鄂渝陕交界,为大巴山脉东段中山地貌。经专家咨询和研讨,依据地质历史和地形地貌特点将其自然地理范围确定为东经109°29′34.8″–111°56′24″、北纬30°57′28.8″–32°14′6″,面积约12837 km²[1]。神农架东起湖北保康县,西至陕西镇坪县,南达湖北巴东县,北至湖北竹溪县。区域范围的主体是湖北神农架林区,同时还囊括湖北兴山县、秭归县、巴东县、房县、竹山县、竹溪县、保康县和重庆巫山县、巫溪县及陕西镇坪县10个县[2]。该区域地处中国东部平原丘陵向西部高原山地过渡及亚热带气候向暖温带气候过渡的地区,具北亚热带季风气候特点[3]。神农架是动植物种类的交汇地和第四纪冰川时期野生动植物的“避难所”,拥有丰富的生物多样性,并于2016年被列入《世界遗产名录》。
一直以来,作为新种发表和物种命名的依附实体,模式标本既是系统分类研究不可缺少的科学依据,也是研究学者开展专科专属研究,编写全国和地方生物志,进行生物区系调查研究、开发、利用和保护生物资源的重要基本资料[4,5,6,7,8]。模式标本的数量是一个国家或地区分类学研究积累的重要反映,其数量越多说明该地区的相关研究越深入,受关注度的程度越高,进行分类与区系研究也就越便利[4,9]。因此,模式物种具有极高的学术价值和保藏价值。
神农架是全球具有国际意义的生物多样性研究与保护关键地区之一,亦是中国种子植物特有属三大分布中心之一,历来受到分类学家的青睐[2]。18世纪后,国内外科学家对神农架开展过多次科学考察,采集并命名了多种动植物物种[10,11,12,13]。新中国成立后,中国科学家对湖北神农架先后开展了地质、地貌、植物、动物、气候等方面的综合调查与研究,并发表了一系列论文与专著,如《神农架鱼类》(内部资料)《神农架自然保护区科学考察集》[10]《神农架地区自然资源综合调查报告》[12]等。但是,对于该地区模式动物的研究相对匮乏,且存在研究内容较为分散、信息更新不够及时等问题。因此,很有必要对神农架地区的动物模式物种及其分类厘定进行整合,以便能较好了解湖北省神农架地区动物模式标本的种类信息及其分类变动,为湖北省野生动物保护工作做好铺垫。
本数据集在参考《神农架动物模式标本名录》[2]《中国昆虫模式标本名录》(第1、2、3卷)[6,7,8]等资料的基础上,对采集并发表于湖北神农架地区的动物模式标本的原始发表文献、标本数量及标本存放机构进行了系统整理,确定了物种有效性和分类归属,尽可能整合最新的研究成果,同时听取专家意见。最终,在专著《神农架动物模式标本名录》的基础上,整理汇总出一套相对完整的湖北神农架地区的动物模式标本名录数据集。
1   数据采集和处理方法
1.1   数据采集
在《神农架动物模式标本名录》的基础上,参考了《中国昆虫模式标本名录》(第1、2、3卷)的分类体系,并通过以下方式进行数据的采集:①以“Shennongjia”和“New species”在Scholar Google(http://www.scholar.google.com/)和Web of Science(http://www.isiknowledge.com)网站上搜索英文文献;②以“神农架”和“新种”在Scholar Google、中国知网(http://www.cnki.net/)和维普网(http://www.cqvip.com/)上搜索中文文献;③查阅相关的志书[6-8,14-15]和专题网站(中国昆虫模式标本数据库 -http://www.zoology.csdb.cn/page/showEntity.vpage?uri=specimen.specimen 及中国昆虫新种数据库http://www.zoology.csdb.cn/page/showEntity.vpage?uri=newinsect.species1)。
1.2   处理方法
我们参考了《中国昆虫模式标本名录》(第1、2、3卷)、《长江三峡库区昆虫》(上、下)[14-15]等专著和国内外发表的文献或书籍,将其中于湖北神农架区域内分布的动物模式物种标本信息汇总整理,同时对模式物种进行分类厘定。本数据集中只列出模式物种在神农架地区的分布信息(正模、配模、副模分别的数量、性别、采集地点、采集时间、原始文献中的标本存放地、参考文献)。基于《神农架动物模式标本名录》一书,本数据集于“备注”部分罗列了部分需要分类讨论的物种,具体内容可参考该书。
2   数据样本描述
本数据集中的名录共由929条记录组成,主要分为2个部分,分别是(1)有效物种名录:以采自神农架的标本为模式标本确定的动物物种915种,隶属于3门8纲31目187科;(2)无效物种名录:14种甄别为无效模式标本的物种。本数据集涵盖了模式物种分类信息(物种编号、物种有效性、物种所属的分类阶元及物种中文名和拉丁学名)、模式标本信息(正模、配模、副模分别的数量、性别、采集地点、采集时间、原始文献中的标本存放地)、文献信息(包括物种发表的原始文献及分类修订的相关文献)、凭证标本是否仅来自于神农架地区及备注。具体的字段名称、类型及示例见表1。
表1   湖北神农架动物模式标本名录示例
字段名数据类型数据样本
编号数值型55
物种有效性字符型有效
字符型节肢动物门
门拉丁名字符型Arthropoda
字符型蛛形纲
纲拉丁名字符型Arachnida
字符型蜘蛛目
目拉丁名字符型Araneae
字符型皿蛛科
科拉丁名字符型Linyphiidae
属拉丁名字符型Gongylidioides
中文名字符型穿孔瘤胸蛛
拉丁学名字符型Gongylidioides foratus
正模数量数值型1
正模性别字符型
正模采集地点字符型湖北神农架木鱼镇
正模采集时间字符型1986. Ⅵ~Ⅷ
正模原始文献中的标本存放地字符型白求恩医科大学生物学教研室
配模数量数值型1
配模性别字符型
配模采集地点字符型湖北神农架木鱼镇
配模采集时间字符型1986. Ⅵ~Ⅷ
配模原始文献中的标本存放地字符型白求恩医科大学生物学教研室
副模数量数值型24
副模性别字符型14♀♀10♂♂
副模采集地点字符型湖北神农架木鱼镇
副模采集时间字符型1986. Ⅵ~Ⅷ
副模原始文献中的标本存放地字符型白求恩医科大学生物学教研室
凭证标本是否仅来自于神农架地区字符型
参考文献字符型(1) 马晓丽, 朱传典. 1990. 中国瘤胸蛛属二新种 (蜘蛛目: 皿蛛科: 微蛛亚科).动物分类学报, 15: 431-435. (2) Tu LH, Li SQ. 2006. A review of Gongylidioides spiders (Araneae: Linyphiidae: Erigoninae) from China. Revue Suisse de Zoologie, 113: 51-65.
备注字符型分类讨论
3   数据质量控制和评估
本数据集是一个基于已出版的专著《神农架动物模式标本名录》整合的数据资料集(库)。在信息汇总、整理过程中,以《中国昆虫模式标本名录》(第1、2、3卷)作为分类阶元的主要参考依据,严格遵循动物模式物种须有规范的模式标本(正模、配模、副模)描述、明确的模式标本存放地(正模、配模、副模分别在原始文献中出现的存放地)、公开的学术刊物(原始发表文献及分类厘定参考文献)、明确的县级(或村、镇)记录的原则。
模式标本的正模、配模和副模,若原始文献未提供其明确的信息,则用“不详”标注。本数据集中的所有数据均来源于公开发表的文献或专著,且每条记录后附有原始文献,可供使用者查询出处。
4   数据价值
模式标本的数量是一个国家或地区分类学研究积累的重要反映,具有极高的学术价值和保藏价值。自18世纪以来,分类学家及相关研究学者在湖北神农架地区开展了大量的科学考察活动,采集并发现了大批物种新记录,撰写了大量学术文章及专著。然而,直至今日,对于神农架地区模式动物的整合性研究仍较为匮乏,且目前的研究结果体现出研究内容较为分散、数据信息较为陈旧、信息更新不够及时等问题。本数据集搜集整理了相关权威网站及发表时间跨度达80余年的国内外文献、专著,内容丰富、全面。本数据集可供从事动物学及保护生物学科研、教学的学者、自然保护科技工作者及自然资源管理人员查阅,为构建其他区域性或大尺度的模式标本数据集提供参考。
致 谢
中国科学院水生生物研究所张浩淼、华中农业大学刘晓艳提供了部分文献,中国科学院植物研究所研究生余小林、崔继法、王冰鑫以及安徽大学陈文文帮助查找了部分文献,湖北神农架国家级自然保护区管理局李立炎、王大兴、李纯清、王志先等提供了相关资料,中国科学院植物研究所申国珍、熊高明、徐文婷、樊大勇、赵常明提供了宝贵建议,在此一并致谢。
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数据引用格式
吴楠, 雷博宇, 周友兵, 谢宗强. 湖北神农架动物模式标本名录[DB/OL]. Science Data Bank, 2019. (2019-08-29). DOI: 10.11922/sciencedb.861.
稿件与作者信息
论文引用格式
吴楠, 雷博宇, 周友兵, 谢宗强. 湖北神农架动物模式标本名录[J/OL]. 中国科学数据, 2019. (2020-01-13). DOI: 10.11922/csdata.2019.0042.zh.
吴楠
Wu Nan
主要承担工作:动物模式标本名录、物种信息收集整理和文章撰写。
(1993—),女,在读博士,研究方向为动植物多样性及种子传播方式的海拔分异。
雷博宇
Lei Boyu
主要承担工作:本文模式标本名录鉴别和文章修改。
(1995—),男,在读博士,研究方向为海拔梯度上果实性状对动植物互惠网络的调控作用。
周友兵
Zhou Youbing
主要承担工作:本文研究思路、框架指导、模式标本名录及物种信息鉴别等。
(1980—),男,博士,副研究员,研究方向为动植物互作关系与森林更新。
谢宗强
Xie Zongqiang
主要承担工作:本文研究思路、框架指导、模式标本名录、物种信息鉴别和文章修改。
xie@ibcas.ac.cn
(1965—),男,博士,研究员,研究方向为森林生态学、保护生态学等。
出版历史
I区发布时间:2020年1月17日 ( 版本ZH2
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